阿赖耶识有生一切法的功能，此能生之因，称为种子，自此种子生起色、心诸法，谓之现行。能生的种子是因，所生的现行是果。当种子生起现行的时候，现行有强盛的势用，剎那间熏习起现行的种子、成为新种子，这就称为“种子起现行，现行熏种子。”在种子起现行时，种子是因，现行是果。而现行熏种子时，现行是因，受熏的新种子是果。这三者是“剎那生灭，与果俱有。”这“种生现”的因果同时，也就是“现生种”的因果。有如烛柱生焰（种生现）之时，同时也正是焰烧柱（现熏种）之时。