读音：[gen1 yuan2 zhong3 zi3]
成佛的根本原因。本迹相对时，迹门不能成为种子，本门才是种子。种脱相对时，文上脱益的不能成为种子，久远下种文底的南无妙法莲华经才是根源的种子。日本大石寺第二十六世日宽的云：“觉知种子，名为作佛。而未觉知根源种子，故云尔”（六卷抄第一八页）。